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El sistema digestivo aloja a una gran cantidad de microorganismos que forman parte de él. La microbiota es una parte necesaria para que el intestino lleve a cabo sus funciones. Por eso, generar y mantener una adecuada microbiota es clave para la promoción de salud y la prevención de distintas enfermedades.
Es tan importante la microbiota que empieza a tener forma en el parto. Es imprescindible para el desarrollo del sistema inmunitario y para la homeostasis. Por eso, las primeras fases de colonización de la microbiota son decisivas.
Son diversos los factores que influyen en cómo una personas adquiere la microbiota. Entre estos se encuentran el tipo de parto, edad gestacional, alimentación inicial y exposición a antibióticos, entre otros.
Así, la lactancia materna ofrece al lactante bifidobacterias, en comparación con los niños alimentados lactancia de fórmula. Los hermanos, las mascotas y el ambiente donde se cría una persona también influyen en la composición de la microbiota.
A la vez que se va introduciendo la alimentación sólida, se va adquiriendo los filos Bacteroidetes y Firmicutes, que son los que permanecen en el adulto, que representan el 90 % de las bacterias intestinales. El otro porcentaje lo forman las Proteobacterias, Actinobacterias, Fusobacterias y Verrucomicrobia. Para completar la microbiota intestinal hay que contar con levaduras, fagos y protistas.

Colonización
En sujetos sanos, los microbiomas orales y salivares contienen millones de microbios que se ingieren a diario con la comida, pero su persistencia en el intestino se ve obstaculizada por muchos factores, como la acidez del estómago, la producción de ácidos biliares, enzimas digestivas y proteínas antimicrobianas en el duodeno y en otras partes del aparato digestivo. Hay otras muchas variables importantes que afectan a la colonización microbiana posterior, como los parámetros químicos, es decir, el pH y las concentraciones de oxígeno; la producción biológica de moco, bilis y anticuerpos, así como aspectos físicos, como son la forma del intestino, peristalsis y tiempo de tránsito.Digestión
En la digestión, el metabolismo la microbiota tiene un papel destacado. Es imprescindible en la digestión de carbohidratos complejos, ya que tiene enzimas que descomponen carbohidratos complejos que el organismo no puede digerir por sí mismo, como es la fibra. Este proceso fermentativo genera ácidos grasos de cadena corta, como el acético, propiónico y butírico. Los mencionados ácidos grasos son una de las principales fuente de energía para las células intestinales, necesarios para que puedan realizar sus funciones. Otra acción de los ácidos grasos es que actúan como moléculas de señalización que regulan los procesos metabólicos en el hígado, el tejido adiposo y los músculos La microbiota intestinal también sintetiza vitaminas del grupo B y vitamina K, esenciales para diversas funciones del organismo y puede convertir compuestos dietéticos inactivos en moléculas bioactivas, como, por ejemplo, la transformación de isoflavonas de la soja en equol, un compuesto con actividad estrogénica.Avances en la investigación
En las dos últimas décadas se han logrado avances considerables en el conocimiento de la microbiota. De hecho, se considera hoy uno de los elementos clave que contribuyen a regular la salud. Prácticamente, todas las zonas del cuerpo están colonizadas por microorganismos, lo que sugiere que existen diferentes tipos de interacción con los órganos. Gracias al desarrollo de herramientas y técnicas moleculares, como son metagenómica, metabolómica, lipidómica, metatranscriptómica, se están descifrando progresivamente las complejas interacciones que se producen entre el huésped y los distintos microorganismos. Hoy en día, las alteraciones de la microbiota intestinal están relacionadas con distintas enfermedades, como la obesidad, la diabetes de tipo 2, la esteatosis hepática, las enfermedades intestinales y varios tipos de cáncer. Esto sugiere que varias vías implicadas en la inmunidad, la energía, los lípidos y el metabolismo de la glucosa se ven afectadas. Referencia:- Gut microbiome and health: mechanistic insights. Willem Mde Vos, Herbert Tilg, Matthias Van Hul and Patrice D Gut. https://doi.org/10.1136/gutjnl-2021-326789